|
| |
|
|
Analyzing the role of the p130Cas SH3 domain in p130Cas-mediated signaling
Gemperle, Jakub ; Rösel, Daniel (vedoucí práce) ; Vomastek, Tomáš (oponent) ; Truksa, Jaroslav (oponent)
IN CZECH Adaptorový protein p130Cas (CAS, BCAR1) propojuje signalizaci od integrinových receptorů s receptory růstových faktorů a ovlivňuje správný embryonální vývoj a tkáňovou homeostázu. Jeho změněná exprese může vyvolat mnoho patologických stavů, včetně nádorového bujení, metastazování a rezistence vůči různým protinádorovým lékům. Molekulární mechanismy, jakými p130Cas přispívá k různým patologickým stavům nejsou zatím jednoznačně popsány. Cílem mé doktorské práce bylo tedy poskytnout nové poznatky o signalizaci p130Cas a o její regulaci. Doména SH3 je nepostradatelná pro signalizaci proteinu p130Cas, ale její vazebné preference/regulace nebyly dosud přesně charakterizovány ani strukturně popsány. Proto jsme začali spolupracovat se skupinou Dr. Veverky (Strukturní biologie) a Dr. Lepšíkem (Výpočetní biochemie, AV ČR). S jejich pomocí jsme pak připravili fúzní chiméry SH3 domény proteinu p130Cas se svými ligandy a provedli strukturní analýzu NMR, která nám pomohla strukturně popsat atypický vazebný motiv SH3 domény proteinu p130Cas. Díky této spolupráci jsem se navíc naučil, jak tyto struktury vizualizovat a analyzovat. Tato práce rozšířila naše znalosti o regulaci vazby mezi p130Cas SH3 a jejími ligandy a dále vedla k vylepšenému modelu vazby mezi Src-p130Cas-FAK. Naše snaha sledovat aktivitu...
|
|
|
Analyzing the role of the p130Cas SH3 domain in p130Cas-mediated signaling
Gemperle, Jakub ; Rösel, Daniel (vedoucí práce) ; Vomastek, Tomáš (oponent) ; Truksa, Jaroslav (oponent)
IN CZECH Adaptorový protein p130Cas (CAS, BCAR1) propojuje signalizaci od integrinových receptorů s receptory růstových faktorů a ovlivňuje správný embryonální vývoj a tkáňovou homeostázu. Jeho změněná exprese může vyvolat mnoho patologických stavů, včetně nádorového bujení, metastazování a rezistence vůči různým protinádorovým lékům. Molekulární mechanismy, jakými p130Cas přispívá k různým patologickým stavům nejsou zatím jednoznačně popsány. Cílem mé doktorské práce bylo tedy poskytnout nové poznatky o signalizaci p130Cas a o její regulaci. Doména SH3 je nepostradatelná pro signalizaci proteinu p130Cas, ale její vazebné preference/regulace nebyly dosud přesně charakterizovány ani strukturně popsány. Proto jsme začali spolupracovat se skupinou Dr. Veverky (Strukturní biologie) a Dr. Lepšíkem (Výpočetní biochemie, AV ČR). S jejich pomocí jsme pak připravili fúzní chiméry SH3 domény proteinu p130Cas se svými ligandy a provedli strukturní analýzu NMR, která nám pomohla strukturně popsat atypický vazebný motiv SH3 domény proteinu p130Cas. Díky této spolupráci jsem se navíc naučil, jak tyto struktury vizualizovat a analyzovat. Tato práce rozšířila naše znalosti o regulaci vazby mezi p130Cas SH3 a jejími ligandy a dále vedla k vylepšenému modelu vazby mezi Src-p130Cas-FAK. Naše snaha sledovat aktivitu...
|
|
| |
|
|
The role of p130CAS in integrin signaling
Janoštiak, Radoslav ; Brábek, Jan (vedoucí práce) ; Brdička, Tomáš (oponent) ; Kořínek, Vladimír (oponent)
IN CZECH Fokální adheze jsou důležitými buněčnými strukturami, které pozůstávají z mnoha signálních a strukturních proteinů. Slouží nejen k ukotvení buňky k podkladu, ale i jako důležitá signalizační centra, která regulují různé buněčné děje jako například migraci, invazivitu, proliferaci a přežívání. Signalizace zprostředkovaná fokálními adhezemi musí být přísně regulována, protože změna v aktivitě nebo expresi mnoha proteinů fokálních adhezí může vést ke vzniku nádorů a tvorbě metastáz. Jedním z nejdůležitějších strukturních proteinů asociovaných s fokálními adhezemi je protein p130Cas. Důležitost proteinu p130Cas v regulaci buněčné migrace a invazivity je velice dobře zdokumentovaná. Protein p130Cas také hraje důležitou roli v regulaci buněčného dělení a přežívaní. Navíc, vysoké hladiny lidského homologu proteinu p130Cas - BCAR1 jsou spojené s agresivnějšími nádory a špatnou prognózou. V průběhu mého doktorandského studia jsem se zaměřil na studium úlohy proteinu p130Cas v integrinové signalizaci. Charakterizovali jsme úlohu fosforylace tyrozinu 12 v jeho SH3 doméně a potvrdili jsme, že tato fosforylace je zvýšená v myších embryonálních fibroblastech transformovaných aktivovaným Src527F v porovnaní s jejich netransformovanými protějšky a také v některých lidských nádorech. Tato fosforylace ruší...
|
|
|
Candidate genes screening for prostate cancer
Semaneková, Viera ; Mareš, Jaroslav (vedoucí práce) ; Šťovíček, Vratislav (oponent)
Karcinóm prostaty je považovaný za jeden z hlavných medicínskych problémov v mužskej populácii, pretože ide o najčastejšie diagnostikovaný zhubný nádor u mužov. Zároveň je to karcinóm s druhou najvyššou mortalitou spomedzi všetkých diagnostikovaných zhubných ochorení v ČR (ÚZIS). Jediným spoľahlivým diagnostickým biomarkerom je v súčasnosti PSA (prostate specific antigen; prostatický špecifický antigén), ktorého hladina je v prípade karcinómu prostaty zvýšená. Táto diplomová práca sa zaoberá štúdiom zmien v expresii génov v karcinóme prostaty, ktoré sú, podľa najnovšej literatúry, spájané s progresiou nádoru a mohli by mať prognostický význam. Ide o gény: VCL (vinculin; vinkulín), SHB (Src homology 2 binding protein) a OCT3 (organic cation transporter 3; transportér 3 katiónov organických zlúčenín). Práca metodicky zahŕňala spracovanie 82 zozbieraných vzoriek prostatického tkaniva a to formou izolácie mRNA. Následne bola použitá metóda RT-PCR k získaniu cDNA, potom elektroforetické spracovanie cDNA a štatistické vyhodnotenie výsledkov. Bola porovnaná relatívna expresia jednotlivých génov vo vzorkách karcinómu prostaty a vo vzorkách BPH (benign prostatic neoplasia; benígna prostatická hyperplázia). Pri génoch SHB a OCT3 bola zistená nižšia expresia vo vzorkách karcinómu prostaty, pri VCL nebol...
|
host ::
RSS.